Medialab-Prado cuenta con un laboratorio den el que se experimenta con distintos procesos de fabricación digital y sus herramientas (cortadora laser, cortadora de vinilos, impresoras 3d y fresadoras). Funciona como taller de prototipado de proyectos, espacio de formación y divulgación de las técnicas de fabricación asistida por ordenador, así como lugar de reflexión teórico-critica en torno a estos procesos y su incidencia en los modelos de producción, distribución y consumo.
Desde el año 2008 Medialab-Prado ha estado experimentando a través de sus talleres de prototipado colaborativo con la fabricación digital y el uso de máquinas de impresión 3d. En su ubicación actual en la antigua Serrería Belga cuenta con un espacio específicamente equipado y dedicado a este fin, con maquinaria de fabricación digital (cortadora láser, cortadora de vinilos, impresoras 3D y fresadoras).